公元1645年

    (清顺治二年)

    曹洞宗祖心函可因赋诗洪承畴督师，讥讽洪承畴负明，惹怒洪承畴，被流放千山(今属辽宁)朝阳寺。祖心函可著有《千山剩人和尚语录》。

    公元1646年

    (清顺治三年)

    曹洞宗觉浪道盛住持天界寺，大振禅风。后因其著述中出现“明太祖”，被捕入狱。

    公元1654年

    (清顺治十一年)

    密云圆悟弟子隐元隆琦应日本僧人逸然之请，赴日本入住长畸兴福寺弘扬黄檗宗风，成为日本黄檗宗之祖。

    公元1657年

    (清顺治十四年)

    顺治皇帝请临济宗憨璞性聪入住万善殿。

    为霖道霈继住鼓山禅寺，弘扬曹洞宗风。

    公元1660年

    (清顺治十七年)

    顺治皇帝选僧受菩萨戒，以临济宗玉林通琇为本师，并赐以“大觉普济能仁国师”号。

    公元1666年

    (清康熙五年)

    临济宗憨璞性聪禅师卒。遗有《明觉聪禅师语录》十六卷。

    公元1671年

    (清康熙十年)

    永觉元贤外出游方。著有《鼓山录》等。

    公元1673年

    (清康熙十二年)

    隐元隆琦禅师卒于日本。著有《普照国师语录》、《普照国师法语》、《松堂集》、《太和集》。

    公元1675年

    (清康熙十四年)

    临济宗玉林通琇禅师卒。遗有《玉林通琇国师语录》。

    公元1702年

    (清康熙四十一年)

    曹洞宗为霖道霈禅师卒。著有《仁王般若经合疏》、《华严经疏论纂要》、《为霖道霈禅师语录》、《禅海十珍》等。

    公元1733年

    (清雍正十一年)

    雍正编成《御制拣魔辩异录》、《御选语录》。并下令将法藏及弟子潭吉弘忍的所有著述焚毁，禁止此系流传。

    公元1736年

    (清乾隆元年)

    四月初六，诏令将各僧尼年貌籍贯、焚修处所清查造册，取具印结，汇送到部，发信度牒。

    公元1773年

    (清乾隆三十八年)

    二月十五，诏令将汉文《大藏经》悉心校核，译成满文。