真言宗所依经教，总有五部：一、金刚顶部(亦名瑜伽部)；二、胎藏部；三、苏悉地部；四、苏婆呼部；五、怛利三昧耶部。金刚顶部以《金刚顶经》为主。此经有十万偈，凡十八会。初会名一切如来真实摄。其经说五部，佛部以毗卢遮那佛为部主，金刚部以阿閦佛为部主，宝部以宝生佛为部主，莲花部以阿弥陀佛为部主，羯磨部以不空成就佛为部主。五部主各有四菩萨为眷属，前右左后而安列。四内供养及四外供养各属四部。四门钩、索、锁、铃亦各属四部。是为三十七尊。此外又有四方贤劫十六大菩萨，表贤劫中一切菩萨。又有五类天，一一类有四天，总有二十天并天后。总有五类，即上界四天、住虚空四天、游虚空四天、地居四天，居地底四天。共成金刚界大曼荼罗。
    胎藏部以《毗卢遮那成佛神变加持经》为主。此经有十万偈，可三百卷。汉地所译是略本十卷。此经中说一百六十心，十缘生句及五轮(地轮、水轮、火轮、风轮、空轮)。此经说：“菩提心为因，大悲为根本，方便为究竟。”依胜义、世俗二谛修行。若依胜义修行，建立法身曼荼罗。若依俗谛修行，依四轮为曼荼罗。本尊圣者若黄色，住地轮曼荼罗，其形方。圣者若白色，住水轮曼荼罗，其形圆。圣者若赤色，住火轮曼荼罗，其形三角。圣者若青若黑，住风轮曼荼罗，其形如半月。大曼荼罗安于八叶莲台，五佛四菩萨安其台叶。中曼荼罗外又有三层曼荼罗：一者，一切如来曼荼罗；二者，释迦牟尼曼荼罗；三者，文殊师利曼荼罗。此名大悲胎藏曼荼罗。
    《苏悉地经》中依三部：即是佛部、莲花部、金刚部。佛部即五佛顶等，莲花部种类甚多，金刚部即金刚萨埵等变化无量。佛部以金刚王佛顶为部主，佛眼为部母，无能胜菩萨为明妃，不动尊为忿怒。莲花部以马头观自在为部主，白衣观自在为部母，多罗菩萨为明妃，忿怒钩为忿怒。金刚部以三世胜金刚为部主，忙莽鸡菩萨为部母，金刚孙那利菩萨为明妃，军荼利为忿怒。有四种界，金刚橛为地界，金刚墙为八方界，金刚网为上方界，密缝为阿三莽儗你界。奉五供养，除阏伽：一、涂香；二、花鬘；三、烧香；四、饮食；五、灯明。月一日至八日应作息灾，白色，北方；九日至十五日应作增益，黄色，东方；十六日至二十三日应作降伏，黑色，南方；二十四日至月尽应作敬爱，赤色，西方。
    《苏婆呼童子经》中说办成就人护摩杵，有金、银、铜、铁、石、水精、怯陀罗木等种种不同。有五股、三股、一股之别。十六指为上，十二指为中，八指乃至一指为下。不持金刚杵念诵者无由得成就。金刚铃是般若波罗蜜义，金刚杵是菩提心义。能坏断常二边，契合中道，有十六菩萨位，亦表十六空为中道。两边各有五股，表五佛、五智，十波罗蜜能摧十烦恼，成十真如，便证十地。
    《怛利三昧耶经》中说修行者住菩提心，大悲志愿，不舍无尽众生界，诵大轮金刚真言，现生一切真言速疾成就。又说不动尊等四十二如来僮仆使者，若承事者，速证无上菩提。