1936年12月，西安事变和平解决，促使国民党承认中国共产党的合法地位，形成以国共两党合作为基础的抗日民族统一战线。按照《国共合作宣言》，1937年9月6日，中华苏维埃共和国临时中央政府驻西北办事处改称陕甘宁边区政府。中共中央决定，林伯渠、张国焘、秦邦宪、董必武、徐特立、谢觉哉、郭洪涛、马明方、高岗为边区政府委员(亦称主席团委员)，主席林伯渠、副主席张国焘。10月12日，国民政府行政院第333次会议通过决议(未正式公布)承认陕甘宁边区直属行政院领导，并任命行政长官。陕甘宁边区政府设秘书处，民政厅，财政厅，财政经济委员会，教育厅，保安司令部等机关。边区政府同时设有参议会。
　　1937年7月12日，国民政府行政院例会正式通过陕甘宁边区管辖范围是：陕西绥德、米脂、葭县、吴堡、清涧、神府、延川、延长、肤施、甘泉、安塞、保安、富县、旬邑、淳化、靖边、安定、定边；甘肃庆阳、合水、宁县、正宁；宁夏盐池，共23个县，总面积为12万平方公里，人口160万。但自八路军主力开赴华北抗日前线后，国民政府却不履行诺言，占去淳化、旬邑、正宁、宁县等县城及村镇数百处，计3.06万平方公里，占边区总面积的26％，人口50万，占边区总人口的31％。
　　1941年11月，为适应新形势，边区辖地分为29个县(市)，266个区，1549个乡。直属县(市)：延安市、延安县、富县、甘泉、固临(宜川4个区，甘泉1个区)延川、安塞、安定、延长、志丹、靖边、神府。
　　三边分区：盐池、定边。
　　绥德分区：绥德、米脂、葭县、吴堡、清涧。
　　关中分区：新正(甘肃正宁1个区，陕西旬邑4个区)、新宁(甘肃宁县与正宁的一部分)、赤水(陕西旬邑与淳化的一部分)、淳耀(陕西淳化3个区，耀县2个区)。(后增加同宜耀县，由陕西同官、宜君、耀县组成，称关中东行政区)。
　　陇东分区：庆阳、合水、镇原(甘肃镇原一部分)、曲子(由庆阳马岭区、固原三岔区、环县5个区组成)、环县、华池(甘肃庆阳大部、陕西定边、靖边各一部分)。
　　1948年，地域扩大，设置黄龙分区、西府分区、榆林分区、大荔分区。
　　1949年3月，陕甘宁、晋绥行政管理统一，成立晋西北和晋南2个行政公署。陕甘宁边区辖16个分区、144个县(市)，面积28万平方公里，人口800多万。
　　新中国成立后，撤消了陕甘宁边区政府建制。
　　1940年4月，陕甘宁边区政府作出《关于新区行政工作的决定》，要求在陇东分区、绥德分区和富县进行试点工作。根据“三三制”原则，富县等地先后选举建立了乡、县两级临时参议会和政府。
　　在陕甘宁边区，最早实行“三三制”的是延安县。1940年初，延安县中区五乡在突击完成工作时，乡政府提出用民选方式组织征粮委员会，由每十二三户居民公选一名代表。全乡共选出27名代表，组成征粮委员会。其中共产党员9人，其余18人为非党人士。这些非党人士中包括有富裕户和绅士。征粮委员会在延安县委、政府和延安工作团的指导、帮助下，在群众中进行充分的解释和动员，精确调查统计，积极组织粮食入仓，提前并超额完成了征收公粮的任务。而且各界人士都认为公粮出得公平合理，也自觉自愿。中共陕甘宁边区中央局及时总结了延安县中区五乡的这一新鲜经验，并号召在边区各地推广运用。毛泽东对这一经验很重视，并批示指出：“共产党员只有与多数非党人员在一道，真正实行民主的‘三三制’，才能使革命工作做好，也才能使党的生活活跃起来。如果由党员包办一切，则工作一定做不好，党员也会硬化不进步”。
　　1941年1月1日，陕甘宁边区政府颁布《陕甘宁边区各级选举委员会组织规程》。之后，边区政府选定延安西川的裴庄乡进行选举试点工作。试点工作从2月初开始，至3月10日结束，全乡共有选民731人，其中妇女选民324人。参加投票选举的有574人，占选民总数的78.5％。共选举出参议会议员25人，候补议员7人。25名议员中，有士绅1人，地主2人，富农6人，中农13人，贫农3人。其中共产党员9人，占三分之一稍多。如果加上当选的7名候补议员，共产党员则占四分之一稍多。乡参议会选出了政府委员7名。裴庄乡的选举试点工作，符合“三三制”的要求。
　　此后，“三三制”政权在陕甘宁边区逐步得到了巩固和发展，使得边区在各项事业中与党外人士的合作不断得到加强，也使得各项事业都有了较大的发展。据1944年底的统计，边区党外人士担任各级政权中行政职务的有3592人。从而团结了边区内部的各阶级、各阶层人士，把边区的政权建设推向一个成熟的新阶段。